Pagkalkula ng Computational Quantum Mechanics: 4 Mga Hakbang

2024 May -akda: John Day | [email protected]. Huling binago: 2024-01-30 13:12

Ang mga pagkalkula sa computational sa kimika at pisika ay maaaring magbunyag ng mga napaka-kagiliw-giliw na mga katangian sa ilang mga specimens (lalo na kung napapailalim sa pagbabago para sa mas mahusay na kahusayan ng isang naibigay na orihinal na tambalan). sa mga pamamaraan, bukod sa mga kadahilanan ng sandali ng dipole, kawalang-tatag, potensyal na mapa ng electrostatic, diagram ng enerhiya at pagkalkula ng propabilistic reaktibiti, kung saan ang paggamit ng mga kalkulasyon ng kabuuan ng computational ay nagpapapaikli sa oras ng laboratoryo, ginagawang malinaw at tiyak kung ang pagbubuo ng isang posibleng tambalan ay mabubuhay. matipid at pansamantalang sinasabi.

Mga gamit

• Quantum
• Pagmomodelo ng Molecule.
• Molekular na mga orbital Orca Avogadro

Hakbang 1: Pagkalkula ng Computational Quantum Mechanics - Avogadro

Bilang unang hakbang, mag-download ng Avogadro na may posibilidad ng pag-input gamit ang Orca software

Sa Avogadro software, garantisado kang lumikha ng iyong mga molekula at i-optimize ang mga ito ng 99.9%; upang maiwasan ang mga salungatan sa utos ng Ctrl + Alt + o, na kung saan ay hindi ginagarantiyahan ang tamang pag-compress ng molekula kapag gumagamit ng mga extension ng input para sa Orca.

Upang ma-optimize ang Molekyul, unang lumikha ng molekula ng interes (malinaw naman), pagkatapos ay mag-click sa E (tandaan na sa ilalim ng E na ito ay may isang pababang arrow), kaya't magkakaroon ng katulad na pagkalkula sa itaas na kaliwang sulok ng screen na naglalaman ng software.

Hakbang 2: Ang Software Orca

Sa wastong pag-input na nagawa nang maayos, mag-click sa tab na mga extension, na tumutukoy pa rin sa Avogadro software, at hanapin ang opsyong ORCA

Mag-click sa Advanced, kapag bumukas ang screen para sa paglikha ng input, at sa Petsa markahan ang opsyong MO at ang pangalawa sa ibaba. - IWAN NG DALAWANG MARKAHAN - upang makakuha ng density ng electron at pinapagana ang mga molekular na orbital habang kinakalkula ang kabuuan na isasagawa ng Orca - mga pamamaraan lamang sa pag-input;)

Pagkatapos ng naturang pamamaraan sa Basic tab, kumpleto pagkatapos ng utos:! RHF SP def2-SVP

ipasok nang tama / maingat ang code …

! Normalprint

% output

I-print ang [P_Basis] 2

I-print ang [P_MOs] 1

magtapos

DETAIL, bago magsagawa ng tulad ng isang pag-download ng operasyon at i-install ang Orca sa iyong computer!

Matapos maisagawa ang mga utos sa itaas, i-click ang Lumikha at i-save ang naturang file. I-inp sa folder kung saan naka-install ang Orca. (Halimbawa: Na-install ko ang Orca sa C drive ng aking computer -> i-save ang file sa loob ng C drive ng iyong computer sa loob ng folder ng Orca).

Hakbang 3: Sa Cmd Run…

Buksan ang cmd at uri:

cd C: / Orca; Ang Orca software ay naka-install sa C drive ng iyong computer … at pindutin ang enter.

Makakakuha ka ng isang screen na katulad ng larawan ng bahaging ito, pagkatapos ng naturang pamamaraan, pansinin kung ang utos ay tama sa pamamagitan ng script C: / Orca> Kung tama ang utos na ito, i-type sa harap ng plus sign (>) ang utos:

orca.exe (ang pangalan ng molekula na nai-save mo sa folder ng Orca).inp> (ang pangalan ng molekula na na-save mo sa folder ng Orca).out

DETALYE - WALANG KAUGNAY SA UTOS AT ANG PANGALAN LANG NG IYONG MOLECULA

Pagkatapos nito pindutin ang ipasok at maghintay … Sa aking kaso napalampas ko ang utos nang maraming beses sapagkat ang multiplicity na kasangkot ay isang kakaibang halaga at ang aking bilang ng mga electron ay kakaiba din, kung mangyari ito baguhin ang multiplicity na halaga sa 2 sa nakaraang hakbang sa Pangunahing (sa Avogadro software).

Hakbang 4: Maghintay ng isang Minuto…

Matapos maibigay ang utos, maghanap ng isang salungguhit sa susunod na linya ng utos ng cmd

kung mayroon, WONDER, na nagpapatuloy … Maghintay ng ilang sandali hanggang lumitaw ang term ng script:

cd: / Orca_

Upang matiyak na ang iyong.out file ay nabuo sa loob ng folder ng pag-install ng Orca, ang isa kung saan nai-save ang input file na nilikha sa Avogadro.

Matapos ang pagkalkula ay tapos na sa pamamagitan ng cmd sa Orca, hanapin ang.out file sa folder ng Orca. Sa sandaling ito maaari mong isara ang iyong Molekyul (Avogadro) at cmd, sa katapusan ang pagkalkula ng kabuuan ay tapos na…

Sa susunod na hakbang, buksan muli ang Avogadro at sa bukas na tab, hanapin ang nabuong.out file at buksan ito; makikita mo na magkakaroon ng iyong molekula sa tabi ng mga halagang HOMO at LUMO Orbital, i-drag ang tab pababa nang kaunti at makikita mo na may mga kalkulasyon para sa mga orbital na magbibigay sa paligid ng 100% na pag-optimize, tulad ng isiniwalat ng imahe.

…at magpakasaya…